La Junta de Directores se encarga de la orientación estratégica general de J-PAL y ayuda a transmitir las actividades de investigación, desarrollo de capacidades y difusión de las políticas. La Junta elige 3 miembros, quienes, junto con los Directores de J-PAL Global y el Director Global de Políticas de J-PAL, forman un Comité Ejecutivo que se reúne con frecuencia para la toma de decisiones relacionadas con la dirección de J-PAL, además de orientar y supervisar al personal de J-PAL en el mundo. Las responsabilidades de los miembros de la Junta de Directores incluyen también el liderazgo de los programas y oficinas regionales de J-PAL.